28-12-2024 18:20
Filip FuljerDear all,today (28 Dec. 2024), I discovered some s
28-12-2024 11:14
Marc DetollenaereDear Forum,On decorticated wood of Populus. I foun
23-12-2024 22:59
Lucian ClanetHello,I'm trying to find information about the Hyp
02-12-2024 16:13
Paul DiederichFlora of Lichenicolous FungiVolume 2 · Hyphomycet
23-12-2024 18:18
Rot BojanHello!I've been working with this small fungus for
21-12-2024 12:45
Marc DetollenaereDear Forum,On naked wood of Fagus, I found some ha
Otidea sp.
Enrique Rubio,
11-01-2008 23:21
Je vous prie une opinion sur cette petite Otidea (ascomata jusqu'a 3 cm long.), que croit dans une foret mixte avec Abies alba et Fagus sylvatica, 1300 m, septembre 2007, dans les Pyrenées.
Spores 9.7-12.1 x 5.6-7; Q = 1.7-1.8. Asques jusqu'a 162 x 10. Medullary excipulum intricata. Ectal excipulum angularis avec poils emergents pigmentées.
Merci par votre aide
Nicolas VAN VOOREN,
12-01-2008 11:14
Re:Otidea sp.
Bonjour.
J'ai déjà étudié cette espèce (cf. photo jointe) d'une récolte provenant du col de Croix-Régis (Rhône), oct. 2006, leg. J. Cavet, dans un bois mêlé de feuillus et de pins. J'avais noté « proche de O. onotica mais à hyménium blanchâtre ». Les spores sont relativement petites, 10-11 x 5-6 µm, elliptiques à un peu oblongues. Je n'ai rien noté à propos de la chair, il faudrait que je refasse une observation.
Un article va bientôt sortir dans le buleltin FMBDS à propos notamment d'Otidea tuomikoskii Harmaja, une espèce décrite de Finlande, retrouvée en France et en République tchèque. Il s'agit d'une otidée auriculaire, très élancée, présentant une surface externe ridée qui, sous le microscope, montre un excipulum ectal particulièrement incrusté.
D'une certaine manière, l'espèce présentée par Enrique présente des affinités certaines avec O. tuomikoskii mais cette dernière possède un hyménium jaune fauve à jaune moutarde. Les spores sont comparables, 10-11 (12) x 5,5-6 (6,5) µm, elliptiques mais jamais oblongues.
C'est à creuser maintenant qu'il existe une deuxième récolte recensée !
J'ai déjà étudié cette espèce (cf. photo jointe) d'une récolte provenant du col de Croix-Régis (Rhône), oct. 2006, leg. J. Cavet, dans un bois mêlé de feuillus et de pins. J'avais noté « proche de O. onotica mais à hyménium blanchâtre ». Les spores sont relativement petites, 10-11 x 5-6 µm, elliptiques à un peu oblongues. Je n'ai rien noté à propos de la chair, il faudrait que je refasse une observation.
Un article va bientôt sortir dans le buleltin FMBDS à propos notamment d'Otidea tuomikoskii Harmaja, une espèce décrite de Finlande, retrouvée en France et en République tchèque. Il s'agit d'une otidée auriculaire, très élancée, présentant une surface externe ridée qui, sous le microscope, montre un excipulum ectal particulièrement incrusté.
D'une certaine manière, l'espèce présentée par Enrique présente des affinités certaines avec O. tuomikoskii mais cette dernière possède un hyménium jaune fauve à jaune moutarde. Les spores sont comparables, 10-11 (12) x 5,5-6 (6,5) µm, elliptiques mais jamais oblongues.
C'est à creuser maintenant qu'il existe une deuxième récolte recensée !
Thierry Duchemin,
14-01-2008 11:46
Re:Otidea sp.
Bonjour,
On pourrait voir ça aussi du côté de O.felina ss.Bres.? tab.1228,2.
Thierry
On pourrait voir ça aussi du côté de O.felina ss.Bres.? tab.1228,2.
Thierry
Enrique Rubio,
14-01-2008 13:57
Re:Otidea sp.
Je ne sais pas, Thierry. Peut etre Nicolas te repondre meilleur...
Merci para ta collaboration
Merci para ta collaboration
Nicolas VAN VOOREN,
14-01-2008 17:12
Re:Otidea sp.
Oui, c'est aussi une possibilité mais la planche de Bresadola montre un hyménium plus jaune.
Thierry Duchemin,
14-01-2008 18:34
Re:Otidea sp.
D'accord Nicolas,Mais O.tuomikoskii a egalement un hyménium jaune.
Nicolas VAN VOOREN,
16-01-2008 19:36
Re:Otidea sp.
Oui, il y a plusieurs otidées à hyménium jaune... :-)
L'espèce présentée ici ne présente pas un hyménium jaune du moins sur les spécimens figurés. Avec la maturation, les variations chromatiques sont toujours possibles chez les Otidea, d'où ma prudence. Enrique m'a expédié une partie de sa récolte, je vais l'étudier dès réception et comparer avec mon matériel et également avec O. tuomikoskii. Je vous communiquerai les résultats.
L'espèce présentée ici ne présente pas un hyménium jaune du moins sur les spécimens figurés. Avec la maturation, les variations chromatiques sont toujours possibles chez les Otidea, d'où ma prudence. Enrique m'a expédié une partie de sa récolte, je vais l'étudier dès réception et comparer avec mon matériel et également avec O. tuomikoskii. Je vous communiquerai les résultats.
Thierry Duchemin,
16-01-2008 23:29
Re:Otidea sp.
OK! merci Nicolas,
Thierry
Nicolas VAN VOOREN,
27-01-2008 15:54
Re:Otidea sp.
J'ai étudié la récolte présentée par Enrique et je confirme les informations communiquées. Le caractère le plus remarquable concerne l'excipulum ectal qui présente une textura angularis d'où émergent des cellules fortement incrustées (granules brunâtres), caractère déjà observé sur O. tuomikoskii et O. papillata. Le relief de la surface externe semble cependant moins prononcé que chez O. tuomikoskii (au microscope cela se traduit par une émergence des cellules incrustées moins longue...). Si l'on ajoute la couleur de l'hyménium, cela fait deux petites différences que je ne sais pas interpréter : soit il s'agit de simples variations, soit il s'agit de deux taxons différents. Dans le deuxième cas, il n'est pas exclus qu'il s'agisse d'Otidea nannfeldtii, décrit comme proche de tuomikoskii mais à extérieur subglabre...
Ci-joint l'article de Harmaja décrivant ces différentes espèces.
Ci-joint l'article de Harmaja décrivant ces différentes espèces.
Thierry Duchemin,
27-01-2008 19:23
Re:Otidea sp.
Bonsoir Nicolas,
Merci pour la reponse,et le document,je vais regarder ça.
Cordialement,
Thierry
Merci pour la reponse,et le document,je vais regarder ça.
Cordialement,
Thierry
Thierry Duchemin,
28-01-2008 11:54
Re:Otidea sp.
Bonjour Nicolas,
Vous avez raison,l'espece de Enrique se situe au niveau de O. tumikoskii et O.nannefeldtii,mais à mon avis serait plus proche de O.tuomikoskii,car O.nannefeldtii à les spores plus courtes.
Les differences au niveau de la couleur de l'hymenium et des cellules de l'exipulum ectal,sont certainement dues à une question de maturation et de conditions de poussée,comme vous l'aviez fait remarquer.
Cordialement,
Thierry
Vous avez raison,l'espece de Enrique se situe au niveau de O. tumikoskii et O.nannefeldtii,mais à mon avis serait plus proche de O.tuomikoskii,car O.nannefeldtii à les spores plus courtes.
Les differences au niveau de la couleur de l'hymenium et des cellules de l'exipulum ectal,sont certainement dues à une question de maturation et de conditions de poussée,comme vous l'aviez fait remarquer.
Cordialement,
Thierry
Enrique Rubio,
29-01-2008 21:34
Re:Otidea sp.
Chers Nicolas et Thierry:
Je te remercie beaucoup l'étude complete de notre Otidea. Je comprends que le donner un nom sûr c'est tres dificile. J'ai aussi des doutes, mais je m'incline par cet ce que tu dis : O. cf. tuomikoskii. O. nanfeldtii paraît qu'elle a les spores assez plus courtes...
Dans le description d' Harmaja existent caractères qu'ils mettent d'accord bien avec notre Otidea, mais les autres non (couleur de la base des ascomas et couleur générale de l'hymenium). J'ignore si cela pouvait entrer ou non à les lmites de la variabilité des espèces. Peut etrezs seulement la genetique moléculaire pouvait nous donner une réponse sûre.
Merci beaucoup par votre aide.
Amitiés
Enrique
Je te remercie beaucoup l'étude complete de notre Otidea. Je comprends que le donner un nom sûr c'est tres dificile. J'ai aussi des doutes, mais je m'incline par cet ce que tu dis : O. cf. tuomikoskii. O. nanfeldtii paraît qu'elle a les spores assez plus courtes...
Dans le description d' Harmaja existent caractères qu'ils mettent d'accord bien avec notre Otidea, mais les autres non (couleur de la base des ascomas et couleur générale de l'hymenium). J'ignore si cela pouvait entrer ou non à les lmites de la variabilité des espèces. Peut etrezs seulement la genetique moléculaire pouvait nous donner une réponse sûre.
Merci beaucoup par votre aide.
Amitiés
Enrique
Thierry Duchemin,
29-01-2008 23:34
Re:Otidea sp.
Bonsoir Enrique,
Merci de cette aimable conclusion,qui resume tout, c'est exact, il n'y aurait que la genetique pour trancher.
Bien cordialement,
Thierry
Merci de cette aimable conclusion,qui resume tout, c'est exact, il n'y aurait que la genetique pour trancher.
Bien cordialement,
Thierry
Nicolas VAN VOOREN,
30-01-2008 09:14
Re:Otidea sp.
Bonjour.
Croire que la phylogénie moléculaire résoud tout comme si cette technique relevait de la magie est un leurre. Elle donne des réponses à condition de poser les bonnes questions car les résultats ne sont pas toujours tranchés et nécessitent, comme avec d'autres techniques, une part d'interprétation (la construction des arbres est produite par des algorithmes mathématiques et il faut donc parfois choisir "son" arbre). Donc si on ne sait pas ce qu'on cherche, on peut passer à côté...
Prenons le cas qui nous intéresse et imaginons que nous produisions un séquençage de la récolte proposée par Enrique et d'une autre attribuée à O. tuomikoskii. On analyse, on compare, etc. et on obtient :
1er cas : même séquence pour les 2 récoltes, donc les différences observées ne sont que des expressions de la variabilité infraspécifique
2e cas : séquence différente mais très proche, donc les différences observées ont une certaine valeur, mais laquelle est déterminante : couleur de l'hyménium ? structure de l'excipulum ? autre caractère non visible ?
3e cas : séquence différente et éloignée, donc l'apparente proximité (ou la faible variabilité selon l'approche) cache en réalité des caractéristiques qui ne s'expriment probablement qu'au niveau moléculaire puisque morphologiquement cela nous semble très proche... Et là, grosse difficulté de faire le « retour sur caractères ».
C'est bien entendu un exemple un peu simpliste mais cela illustre bien pour moi que le résultat devra de toute façon être évalué et interprété pour lui donner du sens. N'est-ce pas ce que nous faisons finalement en employant nos propres techniques de détermination ?
La phylogénie moléculaire amplifie seulement le nombre de caractères mesurables.
Croire que la phylogénie moléculaire résoud tout comme si cette technique relevait de la magie est un leurre. Elle donne des réponses à condition de poser les bonnes questions car les résultats ne sont pas toujours tranchés et nécessitent, comme avec d'autres techniques, une part d'interprétation (la construction des arbres est produite par des algorithmes mathématiques et il faut donc parfois choisir "son" arbre). Donc si on ne sait pas ce qu'on cherche, on peut passer à côté...
Prenons le cas qui nous intéresse et imaginons que nous produisions un séquençage de la récolte proposée par Enrique et d'une autre attribuée à O. tuomikoskii. On analyse, on compare, etc. et on obtient :
1er cas : même séquence pour les 2 récoltes, donc les différences observées ne sont que des expressions de la variabilité infraspécifique
2e cas : séquence différente mais très proche, donc les différences observées ont une certaine valeur, mais laquelle est déterminante : couleur de l'hyménium ? structure de l'excipulum ? autre caractère non visible ?
3e cas : séquence différente et éloignée, donc l'apparente proximité (ou la faible variabilité selon l'approche) cache en réalité des caractéristiques qui ne s'expriment probablement qu'au niveau moléculaire puisque morphologiquement cela nous semble très proche... Et là, grosse difficulté de faire le « retour sur caractères ».
C'est bien entendu un exemple un peu simpliste mais cela illustre bien pour moi que le résultat devra de toute façon être évalué et interprété pour lui donner du sens. N'est-ce pas ce que nous faisons finalement en employant nos propres techniques de détermination ?
La phylogénie moléculaire amplifie seulement le nombre de caractères mesurables.
Thierry Duchemin,
30-01-2008 14:17
Re:Otidea sp.
Bonjour Nicolas,
C'est bien dans ce sens que j'interprete la genetique,c'est pour qu'elle vienne affirmer ou infirmer les observations macro et micro qui sont primordiales.
Cordialement,
Thierry
C'est bien dans ce sens que j'interprete la genetique,c'est pour qu'elle vienne affirmer ou infirmer les observations macro et micro qui sont primordiales.
Cordialement,
Thierry
Nicolas VAN VOOREN,
06-02-2008 17:06
Re:Otidea sp.
Pour information, j'ai demandé à Harri Harmaja ce qu'il pensait de cette récolte. Pour lui, ce n'est pas Otidea nanfeldtii, notamment à cause des spores.
Thierry Duchemin,
06-02-2008 17:51
Re:Otidea sp.
Merci de l'info.
Thierry
Thierry
Enrique Rubio,
06-02-2008 19:08
Re:Otidea sp.
A-t-il dit (Harmaja) si elle) pourrait etre O. tuomikoskii ?
Nicolas VAN VOOREN,
07-02-2008 12:14
Re:Otidea sp.
Non, il n'a rien dit de tel mais il n'a pas dit explicitement le contraire... Je lui poserai la question en étant plus précis. Par ailleurs, j'ai oublié de préciser que j'avais révisé le matériel proposé en photo (col de Croix-Régis). L'excipulum présente bien la même structure avec des hyphes incrustées. J'en ai profité pour revoir d'autres récoltes, dont une (leg. G. Corriol, sous Picea abies, à Nadayat, Puy-de-Dôme) que j'avais déterminé sans conviction O. onotica "forme pâle". Bingo ! Spores de 11-12,5 (13,2) x 6-6,5 µm, et excipulum ectal à hyphes incrustées. Cela correspondrait assez bien macroscopiquement à ce que nous avons appelé O. papillata f. pallidefurfuracea mais les spores sont plus grandes donc plus en adéquation avec « O. pseudotuomikoskii ».
Je joins la photo de Gilles Corriol.
Je joins la photo de Gilles Corriol.
Thierry Duchemin,
07-02-2008 17:51
Re:Otidea sp.
Bonsoir Nicolas,
Merci de toutes ces precisions.
Cordialement,
Thierry
Merci de toutes ces precisions.
Cordialement,
Thierry
Enrique Rubio,
07-02-2008 20:32
Re:Otidea sp.
Merci a tous